七月初四日，在担忧和彷徨中的人们终于得到一个消息：太子由霍璜押管，从东宫转到明狱，同时废太子诏书也公布出来。其实陈理和陈兹、陈茂一直被囚禁在明狱，只有几位看管太子的禁军将领和狱卒以及东宫的人知道。不久，刑部以郝连光、袁弥征之流杀东宫掌事内侍左毕为由处死了她们。
诏书中废太子的理由是：六月十一日夜，太子带兵闯未禧宫欲杀贵妃；此前，太子纵容东宫舍人狎妓；太子私留敏王、据王夜宿东宫，太子引起春闱考生投卷案；太子乳母之女滥杀无辜、太子不顾法度维护……在定太子诸多罪责中，皇帝未曾提到太子矫诏调兵，显然是要刻意隐瞒，才将所有罪责全部推给敏王和据王。
同一日，皇帝又下了杀敏王兹、据王茂的旨意。圣旨里除了指出敏王兹、据王茂一些罪状，又指出，从他们府内收藏的兵器上发现了敏王、据王的字样，此外从东宫搜出很多封敏王、据王写给太子的信笺，里面出现很多篡位字句，其意皆要鼓动太子谋反。并有证据指出敏王和据王曾秘密联络皇甫氏、贺氏撺掇太子僭越皇权。随后，收缴皇甫氏、贺氏在华州、黔州、灵州等地产业、皇甫氏和贺氏族人剥夺官职或被赐死的圣旨也发了出去，如皇甫德以拱卫禁苑引发杀人失职为由被赐死，同时被赐死的还有裴塘。此外，刑部左侍郎裴周靖被贬到广元郡穷山恶水之处任无品无序的驿臣，家人也全部随行。此举算是将裴氏全部摒除朝廷。
次日，韦皇后被人带到到乾嘉殿单独受皇帝审讯。审讯中韦皇后力证太子不是故意到未禧宫，而在她宫里抓住的两个刺客实际上是殷氏在华州秘养的死士，又拿出证据呈现给皇帝。
“陛下，罪妾被禁在元坤宫多年，深知擅罗贵妃证据是罪上加罪，可罪妾亦懂得陛下为国事操劳，是为了天下臣民安康。罪妾无能，能做的只有这些。只希望陛下能饶恕罪妾过往之罪，继续善待韦氏一族。”韦皇后跪地仰首道，其神情淡漠。
从韦皇后被禁足，殷贵妃才不再对韦皇后存防备心，但是她一直谋皇后之位不得，除了朝臣的反对，还因为韦氏仍是皇后。上次放两个刺客到元坤宫也是计划中的——因为这些年太子对韦氏多有笼络，对韦皇后也非常上心，不单单节时问安、日常也多有照顾。她担心与己不和、还有几位能人武将的韦氏和太子走得更近，才想借一次事件连韦氏也除掉。而皇帝早为了罗列殷氏的证据，想起离未禧宫最近的元坤宫，以及韦皇后对皇帝的深情，才暗示韦皇监视殷贵妃这么多年。
皇帝叹了口气：“这些年，你受的委屈，早抵过你曾做下的错事，更何况你为朕做得不少——起来吧！日后朕仍以你为皇后，并许韦氏一族世代荣华。”
韦皇后却摇头，“陛下的恩典，请只留给韦氏族人。罪妾日后还是禁足在元坤宫，只求陛下准许罪妾清净度过余生，再也不涉及任何争端。”
她这话明了，可见当年曾跋扈的韦皇后，已然变成了一个人。只听她又诚恳道：“罪妾还有一个请求，请让罪妾见一见穆王，罪妾要亲自向他谢罪。”
她言词恳恳，皇帝也为之动容，“十年前，不全是你的错——”
“不，是罪妾的错。”韦皇后截断皇帝的话，苦笑，“是罪妾心胸狭窄，嫉恨贤妃有子，才逼得他母子分离，与李家无任何关系。”又抬眼定定地看住皇帝，“罪妾发誓，只向穆王陈述当年夺子之恶心，其他绝不妄谈。此后，罪妾仍是陛下名义上的皇后，断绝其他人觊觎后位，除非陛下心想事成，罪妾会自请收回皇后御玺，韦氏也将永远效忠陛下绝无二念。”
皇帝不由深深看了一眼韦皇后。当初他立寒门韦氏为后，除了韦氏子弟骁勇，还因为看出小门小户出生的韦氏心胸不广却做事果决，日后可以控制几位门阀勋贵出生的妃子。果然，他没有看错人，韦皇后竟然每次都准确领会清楚他的心思，能做别人不能做的事，帮助打压过李氏和裴氏……
她刚才又说要断绝其他人觊觎皇后位，是明白皇帝最想立的皇后是悦妃纪氏，如果后位空缺，后宫还有的勋贵门阀之女难免不会妄动手脚，所以她甘愿继续为皇帝抵挡麻烦……
想到这里，皇帝突然对她产生心心相惜感，但仅仅是心心相惜，并无其他。
又过了两日，敏王、据王被赐死在鄣西山坟场一块荒废的芦苇荡中，他们的妻妾子女即日被贬为庶人流放岭南。皇帝这样快赐死儿子，是因为敏王、据王在狱中竟然还和皇甫氏、贺氏联络，而皇甫氏和贺氏准备凭持手中的权利已有举兵反朝廷的迹象。于是皇帝只好先杀子警告。
这圣旨一下，同时被关进明狱的陈涛吓得神经错乱，以为不久也将赐死他，于是在明狱又待了一天后就悬梁自尽了。按规皇子被囚会有人把守看管，他在悬梁时竟然无人在侧，这又不得不使人怀疑是皇帝故意让他自裁。其实不然，皇帝得知燕王涛死后，非常悲伤和愤怒。顾贵嫔闻讯，伤心中去簪脱服请求打入冷宫，希望以此保全顾家，加上章令潜首次因为此事出面维护顾桡，皇帝才没有对顾桡追责。
同样以渎职为由被关在刑部大牢司马清焕和吴岩，从未接到任何不好的处置旨意。曾与于才智在万华楼私论边患朝政的司马祁与其家人，还被禁足在陶和长公主府，而驻守在西凉郡的司马清庭并没有被召回京。正如殷贵妃对宣益公主所说，司马家不会出大事。
使人迷惑的是，皇帝到现在也未提出半句对殷氏的不满，还不时从后宫传出皇帝非常在意贵妃的身体，已有数名内廷奚官因不能医好贵妃的病被责罚，还有向民间征名医的口谕传来。对于忠王昶在越州回京途中在华州失踪，皇帝也表现得很淡定。很多人又开始猜想，说陛下曾多次在广庭之下赞誉和嘉奖忠王，比如今年初皇子授冠礼忠王得到皇帝单独受教、 潍水河拓道加封忠王为越州牧，封拥有实权的工部侍郎和潍水河御史总监，这是其他皇子很少获得的优待……贵妃在未禧宫失火后精神恍惚，陛下爱惜贵妃，忠王其实早已回宫伺奉生母，陛下珍视忠王，才故意散播失踪一说。仿佛殷贵妃的确是个受害者。
不久，皇帝指派数十名内臣带人到华州、黔州等地追缴皇甫氏和贺氏的产业，内臣刚到华州城内，就遭遇殷长原的死士追杀，后来前来协助的三千华州军也几乎全被杀死。已经掌控华州、的殷长原就这样